В центральной части города на дне реки Вологда отмечено животные 72 видов (моллюски, малощетинковые кольчатые черви (олигохеты), личинки комаров-звонцов, ручейников, стрекоз). Ниже по течению после города – всего 15 видов. В центре города в среднем на одном квадратном метре дна реки встречается 3200 животных. Наиболее многочисленны малощетинковые черви.