В черте города в реке Вологда зарегистрировано 55 видов планктонных животных, из них коловраток – 31, ветвистоусых ракообразных – 16, веслоногих ракообразных – 8 видов. Наиболее многочисленны коловратки и веслоногие рачки. Летом число животных, свободно парящих в толще воды в реке, достигает 60 тысяч особей в одном кубическом метре воды.